1、科属区别：仓鼠是仓鼠科中的一个亚科，温带陆生动物，在开阔的地区最为常见。而老鼠是哺乳纲、啮齿目、鼠科的啮齿类动物。
2、食性区别：仓鼠主要以植物种子为食，兼吃植物嫩茎和叶、果实，偶尔也吃昆虫。而老鼠是杂食性动物，爱吃的东西很多，几乎人们吃的东西都吃，酸、甜、苦、辣全不怕，但最爱吃的是谷物、瓜子、花生和油炸食品。
3、外形区别：仓鼠的身体较为肥圆，上下颚各有一对锐利的门齿，除分布在中亚的小仓鼠外其他种类的仓鼠两颊皆有颊囊，从臼齿侧延伸到肩部。而老鼠的身体呈锥形，体色以灰、褐色为主，无犬齿，门齿与前臼齿或臼齿间有间隙、门齿发达、无齿根，终生生长，常啮物以磨短。
